Az MKSZ – ben kisorsolták a negyeddöntők párosításait is: Csurgói KK – Balatonfüredi KSE/Pick Szeged párharc győztese; Ceglédi KKSE – MKB MVM Veszprém; FTC-Bástyamillenium – B.Braun Gyöngyös és ETO-SZESE – THAC/Grundfos Tatabánya KC párharc győztese.
A párharcok azonos osztálybeli csapatoknál két mérkőzésesek lesznek, a különböző ligában szereplő ellenfelek esetén pedig az alsóbb osztálybeli csapat rendezésével egy mérkőzésen dől el a továbbjutás.
A kijelölt játéknapok: 2014. január 29. és február 26. A négyes döntőt: 2014. április 12 – 13 – án rendezik.
| 1. ONE Veszprém HC | 48 |
| 2. OTP Bank - PICK Szeged | 41 |
| 3. MOL Tatabánya KC | 36 |
| 4. FTC-Green Collect | 28 |
| 5. Balatonfüredi KSE | 24 |
| 6. LIQUI MOLY NEKA | 23 |
| 7. PLER-Budapest | 22 |
| 8. Csurgói KK | 19 |
| 9. ETO University Handball Team | 19 |
| 10. Budai Farkasok-RÉV | 18 |
| 11. HE-DO B.Braun-Gyöngyös | 16 |
| 12. Szigetszentmiklósi KSK | 15 |
| 13. Carbonex-Komló | 13 |
| 14. CYEB-Budakalász | 12 |